LAMMPS用ワークステーション

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事例No.PC-12119

参考価格：
2,611,400円

用途：分子動力学計算、DFT計算 (LAMMPSとCP2Kの利用)

お客さまからのご相談内容

分子動力学計算のために128~256コアのワークステーションを購入したい。主にLAMMPS、CP2Kを使用する予定がある。おすすめの構成を教えて欲しい。

使用ソフトウェア：LAMMPS、CP2K
ご予算：200万～300万円

なお、現在進めている研究ではLAMMPSのGPU機能を使用していない。DFT計算にはCP2Kを使用しているが、こちらも同様にGPUを使用していない。ラックマウント筐体を採用しても問題ないので、要望に近い構成を提案して欲しい。

テガラからのご提案

CPUについて

AMD EPYCによる、128コア 256スレッド構成です。

128コア以上の場合にはラックマウント筐体を用いた構成が前提で、専用仕様のためコストが大きく上がります。しかし、コストの上昇に対して増えるコア数はそれほど多くないため、コストパフォーマンスを優先して検討しています。

スペックについて

予算に余裕がありますので、メモリモジュールは12枚構成を推奨します。メモリチャネルが12chですので、計算速度の向上が期待できます。ただし、LAMMPSのメモリ使用量によってはオーバースペックになる可能性がありますので、実際の処理で必要なメモリ容量をご確認ください。

SSD容量は2TBとしています。LAMMPSやCP2Kで扱うデータ量からの選定ですが、ストレージ容量に指定がある場合にはご相談ください。

GPUについて

GPUを使用しないとのことですが、LAMMPSやCP2KはGPU計算に対応していますので、RTX4090を1枚搭載した構成としました。 (ただし、単精度計算です)

■LAMMPS GPU対応について | 7.4.1. GPU package – LAMMPS documentation

■CP2K GPU対応について | gpu [CP2K Open Source Molecular Dynamics ]

主な仕様

CPU	AMD EPYC 9754 2.25GHz 128C/256T
メモリ	合計 768GB DDR5 4800 REG ECC 64GB × 12
ストレージ	2TB SSD M.2 NVMe Gen4
ビデオ	NVIDIA Geforce RTX4090 24GB
ネットワーク	on board (10GBase-T x2)
筐体+電源	ミドルタワー型筐体 + 1600W
OS	Ubuntu 24.04

分子動力学 (MD)特定ソフトウェア動作最適化 GPGPU コア数重視デスクトップワークステーション 1CPU AMD 512GB・768GB 構成 NVIDIA Geforce Linux 200万円以上

■キーワード

・LAMMPSとは

LAMMPS (Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator) は、米国のサンディア国立研究所で開発されたオープンソースの分子動力学計算アプリケーション。パラメータ設定により対応する力場の幅広さと柔軟さに定評がある。

参考：LAMMPS Molecular Dynamics Simulator ※外部サイトに飛びます

・CP2Kとは

CP2Kは原子レベルのシミュレーションを行うオープンソースソフトウェア。様々な計算手法 (DFT、QM/MMなど) と効率的なアルゴリズムを使用している。高い並列性能を持ち、固体物理学、液体物性、分子ダイナミクス、生体分子、材料科学、表面化学などの分野で利用されている。

参考：about [CP2K Open Source Molecular Dynamics ] ※外部サイトに飛びます

事例追加日：2024/10/07

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ご注文の流れ

	お問い合わせフォームよりご相談内容をお書き添えの上、お問い合わせください。（お電話でもご相談を承っております）
	弊社より24時間以内にメールにてご連絡します。
	必要に応じてメールにて打ち合わせさせていただいた上で、メール添付にてお見積書をお送りします。
	お見積もり内容にご納得いただけましたら、メールにてご注文ください。ご注文確定後、必要な部材を手配し PCを組み立てます。 (掛売りの場合、最初に新規取引票のご記入をお願いしております)
	動作チェックなどを行い、納期が確定いたしましたらご連絡いたします。 (納期は仕様や製造ラインの状況により異なります)
	お客様のお手元にお届けいたします (ヤマト運輸/西濃運輸)

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お支払い方法は、お見積もりメール・お見積書でもご案内しています。

法人掛売りのお客様

原則として、月末締、翌月末日払いの後払いとなります。

学校、公共機関、独立行政法人のお客様

納入と同時に書類三点セット（見積書、納品書、請求書）をお送りしますのでご請求金額を弊社銀行口座へ期日までにお振込み願います。
先に書面での正式見積書（社印、代表者印付）が必要な場合はお知らせください。

企業のお客様

納品時に、代表者印つきの正式書類（納品書、請求書）を添付いたします。
ご検収後、請求金額を弊社銀行口座へお支払い期日までにお振込み願います。

銀行振込(先振込み)のお客様

ご注文のご連絡をいただいた後、お振込みを確認した時点で注文の確定とさせていただきます。

修理のご依頼・サポートについて

弊社製PCの保証内容は、お見積もりメールでもご案内しています。

■お問合せ先
テガラの取り扱い製品に関する総合サポート受付のWEBサイトをご用意しております。
テガラ株式会社サポートサイト

※お問い合わせの際には、「ご購入前」と「ご購入後」で受付フォームが分かれておりますので、ご注意ください。

メール	support@tegara.com
電話	053-543-6688

■テグシスのサポートについて
保証期間内の修理について

保証期間内におけるハードウェアの故障や不具合につきましては、無償で修理いたします。
ただし、お客様による破損や、ソフトウェアに起因するトラブルなど保証規定にて定める項目に該当する場合は保証対象外となります。
保証期間経過後も、PCをお預かりしての初期診断は無料で実施しております。

無料メール相談
PCの運用やトラブルにつきまして、メールでのご相談を承ります。経験・知識の豊富な技術コンサルタントが無料でアドバイスいたします。
※調査や検証が必要な場合はお答えできなかったり、有償対応となることがあります

オプション保証サービス

「あんしん＋」　もしもの時の延長保証サービス

PCのご購入時にトータル5年までの延長保証をご選択いただけます。また、ご購入後にも延長保証を申し込むことができます。
延長を申し込みいただきますと、標準保証と同等の保証を期間満了まで受けることができます。
なお、PCの仕様によっては料金が異なる場合があります。

延長保証あんしん＋ご加入のタイミング
※仕様によっては保証期間の延長ができない場合があります。

HDD返却不要サービス

保証期間内にPCのHDD(SSD)が故障した場合、通常、新品のHDDとの交換対応となり、故障したHDDはご返却いたしません。
しかしこの「HDD返却不要サービス」にご加入いただければ、保証期間内にHDD(SSD)が故障した場合には新品のHDDをご提供いたしますが、故障したHDDを引き渡していただく必要はありません。お客さまの大切なデータの入ったHDDをお手元に保管しておくことができます。